当订立合作合同出现纠纷时，可采取以下处理方式：

  1. 协商解决：双方通过友好协商达成一致，修改或补充合同条款。
  2. 调解处理：委托第三方机构（如商会、调解中心）进行调解。
  3. 仲裁程序：若合同中有仲裁条款，可向约定仲裁机构申请裁决。
  4. 诉讼途径：向有管辖权的人民法院提起诉讼，通过法律程序解决争议。

建议在合同中明确争议解决条款，并保留相关书面证据。