处理合作合同纠纷通常遵循以下步骤：

  1. 协商调解：双方优先通过友好协商解决分歧，可邀请第三方调解。
  2. 合同审查：仔细核查合同条款，明确各方权利义务及违约条款。
  3. 律师咨询：寻求专业律师帮助，评估法律风险并发送律师函。
  4. 仲裁/诉讼：若协商无果，按合同约定选择仲裁机构或向法院提起诉讼。
  5. 证据保全：保留往来函件、转账记录等关键证据。

提示：签订合同时建议明确争议解决方式和管辖地，降低纠纷成本。