配资合同纠纷处理方式如下：

  1. 协商解决：双方可先尝试协商，明确合同条款争议点，达成和解协议。
  2. 调解途径：通过第三方机构（如金融调解中心）介入调解，快速解决纠纷。
  3. 法律诉讼：若协商调解无效，可向法院提起诉讼，需准备合同文本、交易记录等证据。
  4. 仲裁程序：若合同中有仲裁条款，可提交仲裁机构裁决，效率通常高于诉讼。

提示：配资合同合法性需优先确认，部分民间配资可能被认定为无效合同。