合作合同纠纷处理通常遵循以下步骤：

  1. 协商调解：双方优先通过友好协商解决分歧，可邀请第三方调解机构参与。
  2. 审查合同条款：明确争议条款的法律效力，检查违约责任、解决机制等约定。
  3. 律师介入：委托专业律师出具法律意见，发送律师函或启动诉讼/仲裁程序。
  4. 司法途径：根据合同约定的管辖方式（法院诉讼或商事仲裁）主张权益。

关键证据包括：原始合同、履约凭证、沟通记录、损失证明等。