合作协议纠纷处理通常遵循以下步骤：

  1. 协商调解：双方优先通过友好协商解决分歧，可邀请第三方调解。
  2. 审查合同条款：明确争议条款的法律效力及违约责任。
  3. 律师函警告：委托律师发送正式函件，要求对方履行义务。
  4. 仲裁或诉讼：根据合同约定的争议解决方式，向仲裁机构或法院提起程序。
  5. 执行措施：胜诉后申请强制执行，如财产查封、冻结账户等。

提示：保留往来凭证、履约记录等关键证据，必要时咨询专业律师。