补发工资的个税计算方式如下：
- 合并计税：补发工资通常与当月工资合并计算个税，适用累计预扣法
- 税率适用：根据补发后当月总收入对应的累计税率表计税
- 特殊处理：部分地区允许分摊到所属月份计算（需提供工资表等证明材料）
- 计算公式：应纳税额=（累计收入-累计免税收入-累计减除费用-累计专项扣除-累计专项附加扣除）×税率-速算扣除数-已预缴税额
示例：某员工补发去年12月工资5000元，当月工资8000元，则按13000元收入计算个税。
注意事项：
- 需与单位确认当地税务执行标准
- 保留补发工资的书面说明材料
- 年度汇算时可重新计算多退少补
