拆迁补偿协议通常需要经过以下部门批准：

  1. 房屋征收部门：负责制定征收方案并组织实施
  2. 市/县级人民政府：对征收决定进行最终审批
  3. 国土资源部门：审核土地性质及使用权变更
  4. 城乡规划部门：确认征收范围符合规划要求
  5. 财政部门：监管补偿资金落实情况
  6. 住房保障部门（如涉及住房安置）：审核安置房相关事宜

注：具体审批流程可能因地区政策差异而有所不同。