单独行政赔偿程序主要包括以下步骤：

  1. 申请阶段：赔偿请求人向赔偿义务机关提交书面申请，载明受害人信息、具体请求、事实依据等；
  2. 受理审查：赔偿义务机关在收到申请后2个月内作出是否赔偿的决定；
  3. 协商程序（可选）：双方可就赔偿方式、金额进行协商；
  4. 决定阶段：出具书面决定书，明确赔偿结果及理由；
  5. 救济途径：若对决定不服，可向法院提起行政赔偿诉讼。

注：需在知道职权行为侵权之日起2年内提出申请。