遇到司法鉴定协议投诉时，建议按以下步骤处理：

  1. 核实协议内容：仔细阅读协议条款，确认是否存在不公平或违法条款。
  2. 收集证据：保存协议原件、沟通记录、付款凭证等相关材料。
  3. 协商解决：优先联系鉴定机构说明问题，要求书面答复。
  4. 行政投诉：向当地司法局或司法鉴定协会提交书面投诉，附证据材料。
  5. 司法途径：必要时可向法院提起诉讼，主张协议无效或索赔。

注意事项：投诉需在知道权益受损后1年内提出，涉及虚假鉴定可同时向公安机关报案。