确定股东出资不足问题可从以下几个方面进行核查：

  1. 验资报告审查：核对公司注册时的验资报告，确认股东实际出资与认缴金额是否一致。
  2. 银行流水比对：追踪股东出资账户的银行流水记录，验证资金是否足额转入公司账户。
  3. 财务账簿审计：检查"实收资本"科目明细，确认股东出资的账务处理是否完整。
  4. 公司章程对照：对比股东实际出资时间与章程约定的出资期限是否存在违约。
  5. 资产权属核查：对非货币出资的股东，需查验资产评估报告及产权过户手续。

发现出资不足时，可要求股东补足出资，或通过股东会决议限制其股东权利，必要时可提起法律诉讼。