股东出资不实的认定主要依据以下法律要件和事实依据：

  1. 未按期足额缴纳出资：股东未按公司章程或协议约定的期限、金额完成出资义务；
  2. 虚假出资行为：通过伪造银行流水、虚假评估报告等方式虚构出资事实；
  3. 抽逃出资：出资后通过关联交易、虚构债务等方式转移公司资产；
  4. 非货币财产高估作价：以实物、知识产权等出资时，评估价值显著高于实际市场价值；
  5. 未办理权属转移：以需登记财产（如房产、专利）出资但未完成过户手续。

司法机关通常结合验资报告、银行流水、资产评估文件等证据综合判定，并可能追究股东补足出资及赔偿责任。