当债务人死亡且遗留公司股权用于抵债时，处理流程如下：
- 确认债权债务关系：核查借款合同、转账记录等债权凭证，确保债务真实有效。
- 查明继承人情况：通过户籍或公证处查询法定继承人，通知其参与债务处理。
- 评估股权价值：委托专业机构对股权进行评估，确定市场公允价值。
- 协商或诉讼：
- 与继承人协商以股权抵债，签订书面协议
- 协商不成可向法院起诉，申请强制执行股权
- 办理变更登记：持生效法律文书到市场监管局办理股权变更登记。
注意事项：
- 若存在多位继承人，需全体同意股权处置方案
- 注意公司章程对股权转让的限制条款
- 税务处理：可能涉及遗产税、个人所得税等
