如果员工拒绝缴纳社保，公司可以采取以下措施：

  1. 书面通知：向员工发送正式书面通知，说明社保缴纳的法律义务及拒绝缴纳的后果。
  2. 协商解除劳动合同：若员工坚持不缴纳，可协商解除劳动关系，避免法律风险。
  3. 向社保部门报备：保留员工自愿放弃社保的书面声明（法律效力有限），并向当地社保部门说明情况。
  4. 依法处理：若员工事后主张权益，公司需补缴社保，但可要求员工返还已发放的社保补贴（需合同明确约定）。

注意：根据《社会保险法》，企业不得免除社保缴纳义务，即使员工签署"自愿放弃协议"也无效。