在借款合同纠纷案件中，如果债务人死亡，债权人可以依法变更执行申请对象。根据《中华人民共和国民事诉讼法》及相关司法解释，主要处理方式如下：

  1. 变更被执行人：债权人可向法院申请变更债务人的遗产继承人为被执行人，但执行范围以遗产实际价值为限
  2. 追加保证人：若存在担保人，可要求担保人承担保证责任
  3. 参与分配：多个债权人时需通过参与分配程序实现债权

需向原执行法院提交：变更被执行人申请书、债务人死亡证明、继承关系证据等材料。法院经审查后作出裁定。