合同纠纷案件的处理措施主要包括以下几种：

  1. 协商解决：双方当事人通过友好协商达成一致意见，签订补充协议。
  2. 调解处理：通过第三方调解机构或律师介入，促成双方和解。
  3. 仲裁程序：根据合同约定的仲裁条款，向仲裁机构申请仲裁裁决。
  4. 诉讼途径：向人民法院提起诉讼，通过司法程序解决纠纷。
  5. 证据保全：及时收集和固定相关证据，为后续处理提供法律依据。
  6. 财产保全：必要时申请财产保全措施，防止对方转移财产。

在处理过程中应当注意诉讼时效、管辖法院等法律问题，建议咨询专业律师。