员工辞退补贴的个税计算方式如下：

  1. 免税部分：当地上年职工平均工资3倍以内的补偿金免征个人所得税
  2. 应税部分：超过3倍的部分，单独适用综合所得税率表计算个税

计算公式：
应纳税额 = (补偿金总额 - 当地上年平均工资×3) × 适用税率 - 速算扣除数

示例计算（假设当地上年平均工资10万元）：

补偿金 免税额度 应税部分 适用税率 应缴个税
25万元 30万元 0元 - 0元
40万元 30万元 10万元 10% 1万元

注：具体执行标准请以当地税务部门最新政策为准