拆迁补偿协议纠纷通常属于行政诉讼范畴。根据《中华人民共和国行政诉讼法》规定，因政府征收行为引发的补偿协议争议，应当通过行政诉讼途径解决。但若协议双方均为平等民事主体（如开发商与被拆迁人），则可能适用民事诉讼程序。

核心判断依据：

  1. 被告主体性质（行政机关/民事主体）
  2. 协议签订时的法律关系属性
  3. 纠纷涉及的具体权利义务内容