拆迁赔偿协议的性质取决于签订主体和协议内容：

  1. 民事纠纷：当协议双方为平等主体（如开发商与被拆迁人）时，属于民事合同纠纷，适用《民法典》
  2. 行政纠纷：若一方为行政机关（如征收部门），则属于行政协议纠纷，适用《行政诉讼法》及相关行政法规

实务中需结合具体条款、签约主体身份及拆迁性质（商业拆迁/政府征收）综合判断。