根据《中华人民共和国刑法》第三百三十六条规定，非法行医罪是指未取得医生执业资格的人非法行医，情节严重的，处三年以下有期徒刑、拘役或者管制，并处或者单处罚金；严重损害就诊人身体健康的，处三年以上十年以下有期徒刑，并处罚金；造成就诊人死亡的，处十年以上有期徒刑，并处罚金。

检察院在办理非法行医案件时，主要职责包括审查公安机关移送的案件材料、决定是否批准逮捕、提起公诉等。具体处罚由法院根据案件事实和情节依法判决。