根据《企业破产法》及相关司法解释规定，出资人未完成出资义务的，在破产清算程序中按以下方式处理：
- 追缴未缴出资：管理人应当要求该出资人履行未尽的出资义务，追缴的出资纳入债务人财产
- 连带责任：发起人应与未履行出资义务的股东承担连带责任（公司法司法解释三第13条）
- 权利限制：未履行出资义务的股东，其剩余财产分配权、表决权等股东权利可受到限制
- 加速到期：法院受理破产申请后，出资人的出资义务视为到期，不受原定出资期限限制
特殊情形处理：
- 出资人以非货币财产出资未办理权属变更的，管理人应要求其补正
- 出资人恶意抽逃出资的，管理人可申请法院予以追回
