股东合法退出公司主要通过以下几种方式：
- 股权转让：股东可将股权转让给其他股东或第三方，需遵守公司章程和相关法律规定。
- 公司回购：符合《公司法》第74条规定情形时，股东可请求公司以合理价格回购股权。
- 公司减资：通过减少注册资本程序退出，需经股东会特别决议并履行债权人保护程序。
- 公司解散清算：当出现法定解散事由时，通过清算程序分配剩余财产后退出。
- 司法途径：出现公司僵局或重大权益受损时，可向法院申请解散公司或强制回购。
注意事项：
- 需审查公司章程对股权转让的限制条款
- 涉及国有资产或外资企业的需履行特殊审批程序
- 退出过程应保留完整的书面文件和法律文书
