公司可以进行分公司股权变更。根据《公司法》相关规定，分公司作为总公司的分支机构，其股权结构变更需由总公司决策并办理相应手续。具体流程包括：

  1. 总公司董事会/股东会决议通过股权变更方案；
  2. 向工商部门提交变更登记申请；
  3. 更新税务、银行等关联信息。

注意：分公司不具备独立法人资格，其股权变更实质是总公司内部资产调整，需确保符合公司章程及国有资产管理规定（如涉及）。