招标质疑程序通常包括以下步骤：

  1. 提交质疑文件：投标人需在规定时间内以书面形式提交质疑函，明确质疑事项及依据。
  2. 形式审查：招标人/代理机构对质疑文件进行格式、时效性等合规性审查。
  3. 实质审查：组织专家对质疑内容进行复核，必要时要求原评标委员会重新评审。
  4. 作出答复：在法定期限内（如政府采购一般为7个工作日）书面答复质疑人。
  5. 后续处理：若质疑成立，可能修改招标文件、重新评标或废标；不成立则说明理由。

注：不同地区/类型的招标程序可能存在差异，需以具体招标文件规定为准。