个体工商户股东纠纷处理方式如下：

  1. 协商解决：股东之间优先通过协商达成一致，签署书面协议明确权利义务。
  2. 调解介入：可向当地工商部门、行业协会或第三方调解机构申请调解。
  3. 法律途径：若协商调解无效，可依据《个体工商户条例》或合伙协议向法院提起诉讼。
  4. 清算退出：协商解散个体户并进行财务清算，按出资比例分配剩余资产。

提示：建议提前在合伙协议中明确纠纷解决条款，避免后续争议。