在执行程序中认定股东出资不实，通常从以下几个方面进行审查：

  1. 公司章程与出资协议：核查股东认缴出资额、出资期限等约定
  2. 验资报告：审查是否存在虚假验资或抽逃资金情形
  3. 银行流水记录：追踪资金流向确认是否实际出资
  4. 财务账簿：检查实收资本科目记载情况
  5. 股东会决议：查看是否存在违法延长出资期限的决议
  6. 执行异议之诉：通过诉讼程序确认股东责任

法律依据主要包括《公司法》第28条及《最高人民法院关于民事执行中变更、追加当事人若干问题的规定》第17-20条。