股东瑕疵出资可能影响其权利行使。根据《公司法》及相关司法解释，股东未履行或未全面履行出资义务的，公司或其他股东可要求其补足出资，并可能限制其利润分配请求权、新股优先认购权、剩余财产分配权等股东权利。但表决权等共益权通常不受直接影响，除非公司章程另有约定。