小规模纳税人土地使用权税费计算方式如下：

  • 增值税：按5%征收率计算，公式为：应纳税额=土地使用权转让收入×5%
  • 城市维护建设税：按增值税额的7%（市区）或5%（县镇）计算
  • 教育费附加：按增值税额的3%计算
  • 地方教育附加：按增值税额的2%计算
  • 印花税：按土地使用权转让合同金额的0.05%计算
  • 土地增值税：根据增值额实行30%-60%四级超率累进税率

注意：小规模纳税人月销售额不超过10万元（季度30万元）可免征教育费附加和地方教育附加。