船舶抵押登记办理流程如下：

  1. 申请材料准备：包括抵押合同、船舶所有权证书、双方身份证明等文件
  2. 提交申请：向船舶登记机关（通常为海事局）提交书面申请
  3. 材料审核：登记机关对提交材料进行形式审查和实质审查
  4. 登记簿记载：审核通过后，在船舶登记簿上记载抵押事项
  5. 发放证书：向抵押权人颁发《船舶抵押权登记证书》
  6. 公告公示：部分情况需进行抵押登记公告

整个流程通常需要5-15个工作日，具体时间取决于材料完整性和登记机关工作效率。