软件著作权补助申请流程如下：

  1. 准备材料：软件著作权证书、企业营业执照、申请表等；
  2. 线上申报：登录当地科技或知识产权部门官网提交电子材料；
  3. 初审：主管部门对材料进行形式审查；
  4. 实地核查（部分区域需）：核查企业实际运营情况；
  5. 公示与拨款：审核通过后公示名单，补助资金拨付至企业账户。

注：具体流程可能因地区政策调整，建议咨询当地主管部门。