解决专利权许可协议纠纷通常可采取以下步骤：

  1. 协商调解：双方通过友好协商或第三方调解达成一致，修改协议条款。
  2. 仲裁程序：根据协议中的仲裁条款，提交专业机构进行具有法律效力的裁决。
  3. 诉讼途径：向法院提起诉讼，需准备专利有效性证明、侵权证据等材料。
  4. 专家评估：委托技术专家或法律顾问对争议点进行专业分析。
  5. 交叉许可：考虑通过交叉许可方式实现专利共享，避免长期纠纷。

建议在协议中明确争议解决机制，并提前进行专利尽职调查以降低风险。