吉林工伤赔偿纠纷诉讼程序主要包括以下步骤：

  1. 工伤认定申请：向当地人社局提交工伤认定申请材料。
  2. 劳动能力鉴定：经认定工伤后，申请劳动能力等级鉴定。
  3. 协商调解：与用人单位协商赔偿，或申请劳动仲裁调解。
  4. 劳动仲裁：调解失败后，向劳动仲裁委员会提起仲裁申请。
  5. 法院诉讼：对仲裁结果不服的，可在15日内向法院起诉。
  6. 执行程序：胜诉后申请法院强制执行赔偿款项。

注：诉讼时效为1年（自仲裁结果送达之日起计算）。