处理没有收养协议的收养关系通常需要以下步骤：

  1. 补办收养手续：向当地民政部门申请补办收养登记，提供双方身份证明及事实收养证明材料。
  2. 收集事实证据：包括共同生活证明（如居住证、学校记录）、经济抚养凭证、邻居证人证言等。
  3. 司法确认：通过法院提起确认收养关系诉讼，依据《民法典》第1111条认定事实收养关系。
  4. 公证途径：双方可到公证处办理事实收养公证，需提供连续共同生活满3年的证明材料。

注意：不同地区可能有具体实施细则，建议咨询当地民政部门或法律专业人士。